合伙企业是指由各合伙人订立合伙协议，共同出资，共同经营，共享有收益，共担风险，并对企业债务承担无限连带责任的营利性组织，又可分为普通合伙企业和有限合伙企业。

1、合伙企业增值税

根据合伙企业的正常业务类型，区分不同的税率和征收率正常缴纳，正常对外开具增值税发票即可，和其他企业并无不同。

2、合伙企业所得税

合伙制企业本身并不具有法人地位，不属于企业所得税纳税主体，自身并不需要缴纳企业所得税，由合伙人缴税。

根据财税[2000]91号文，合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。

对合伙企业而言，被穿透的只是所得税。

对于流转税而言，合伙企业仍然是纳税主体。财税[2016]36号文第一条规定，“在中华人民共和国境内销售服务、无形资产或者不动产(以下称应税行为)的单位和个人，应当按照本办法缴纳增值税。”因此合伙企业属于增值税的纳税主体，其生产经营所得应对照适用税率缴纳增值税。

从事股权投资的有限合伙企业，股权转让所得不需要缴纳增值税，但企业在二级市场出售股票的行为，应比照国家税务总局2016年第53号公告第五条对限售股买入价格的判定标准，按照“金融商品转让”品目缴纳增值税。

股息红利并入生产经营所得缴税

对于合伙企业取得的生产经营所得，财税[2000]91号文规定，按照每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得，适用5％—35％的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。但对于合伙企业对外投资取得的股息红利所得，不并入企业的收入，应作为合伙人取得的股息红利，单独纳税。合伙人为自然人，“按‘利息、股息、红利所得’应税项目计算缴纳个人所得税”（国税函[2001]84号）；合伙人为法人，取得的股息红利由于不属于“居民企业直接投资于其他居民企业取得的投资收益”，因此不能享受居民企业之间的股息红利免征企业所得税政策，应并入法人合伙人当期应纳税所得额，按25%缴纳企业所得税。

3、合伙人所得税

对合伙企业生产经营所得和其他所得，应按“先分后税”原则征收所得税，以每一合伙人为纳税人，分别缴纳个人所得税或企业所得税。自然人合伙人缴纳个人所得税，法人或者其他机构缴纳企业所得税。

《财政部、国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》(财税[2008]159号)规定合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税;合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。

有限合伙企业合伙人：

股东为自然人承担个人所得税：根据财税[2000]91号文，合伙企业比照个人所得税法的“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5％—35％的五级超额累进税率计算征收个人所得税。

备注：执行有限合伙企业合伙事务的自然人普通合伙人，按“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%-35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。不执行有限合伙企业合伙事务的自然人有限合伙人，其从有限合伙企业取得的股权投资收益，按“利息、股息、红利所得”应税项目，依20%税率计算缴纳个人所得税（以地方执行政策为准）。因此符合条件的有限合伙企业，自然人有限合伙人可以享受20%优惠税率，自然人普通合伙人，仍然适用五级超额累进税率计算缴纳个人所得税。

股东为企业承担企业所得税：合伙人是法人组织的情况，按照企业所得税来缴纳，适用25%的税率。

疑点1：如果合伙企业的利润留存在企业，一直不作分配，合伙人需不需要缴税？

财税[2008]159号文规定：“合伙企业生产经营所得和其他所得采取‘先分后税’的原则”。“先分后税”：“先分”是指“应分配”的所得，而不是实际分配的金额。合伙企业的应纳税所得额中不仅包含分配给合伙人的利润，也包括应分而未分的留存收益。因此，即使合伙企业对其利润未做分配，也应该按照税法规定的分配比例，计算每个合伙人的应纳税所得额。（这个是与有限公司不同的地方，有限公司是有分红才纳税，不分红不纳税，因为有限公司分红的那部分是已经缴纳过企业所得税的，而合伙企业用于分配的利润还没有缴纳所得税。）

疑点2：合伙企业亏损如何处理？

合伙企业亏损了，是否也可以享受有限公司那种亏损可以税前弥补的政策，得区分两种情形，一个是法人投资者，一个是个人投资者。法人投资者，还是159号文的规定，合伙企业的合伙人是法人和其他组织的，合伙人在计算其缴纳企业所得税时，这部分投资损失是不能当时就跨企业抵扣的，而是要等到这家被投资的合伙企业以后盈利了，用亏损来抵减盈利，用这种方式来体现当时没有调整的投资损失。当然如果合伙企业亏损的当年就关门清算了，那法人的股权投资损失是可以税前抵扣的。

对于合伙企业，无论投资者是个人还是法人，适用的政策与一般企业相同，只是对于法人投资者而言，合伙企业的亏损不能当时跨企业抵减。